Se puede emplear la inmunocitoquímica en ejemplares para microscopia electrónica mediante marcación del anticuerpo con ferritina, molécula electrón-densa, en vez de un colorante fluorescente. La marcación con ferritina se puede aplicar tanto al método directo como al indirecto.

Autorradiografía

La autorradiografía (radioautografía) es un método de utilidad particular para localizar e investigar una sucesión temporal específica de acontecimientos. El método requiere incorporación de un isótopo radiactivo, más a menudo tritio (3H), en el compuesto que se esta estudiando (fig,1-6L), Un ejemplo sería el empleo de un aminoácido tritiado para seguir la síntesis y el empacamiento de proteínas. Después de la inyección del compuesto radiomarcado en un animal, se le toman muestras de tejidos a intervalos determinados. Los tejidos se someten al procesamiento ordinario y se colocan sobre un portaobjetos, pero en vez de cubrirlo con el cubreobjetos se coloca sobre este una capa delgada de emulsión fotográfica.